Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scn1bP97952 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scn1bP97952 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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