Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43cP86449 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms