Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf3P70671 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms