Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Capza3P70190 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capza3P70190 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms