Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sumo1P63166 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo1P63166 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms