Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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