Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms