Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CckbrP56481 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CckbrP56481 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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