Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1P56183 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms