Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp10P52479 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp10P52479 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp10P52479 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp10P52479 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp10P52479 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp10P52479 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp10P52479 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp10P52479 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp10P52479 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms