Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ClgnP52194 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms