Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TspoP50637 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TspoP50637 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms