Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms