Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp3P49194 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms