Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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