Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkx1-2P42580 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkx1-2P42580 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms