Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf9P41274 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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