Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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