Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ThpoP40226 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms