Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lig1P37913 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms