Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddit3P35639 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms