Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcr2P35343 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms