Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sftpa1P35242 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sftpa1P35242 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sftpa1P35242 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sftpa1P35242 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sftpa1P35242 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sftpa1P35242 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sftpa1P35242 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms