Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd1P33215 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms