Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms