Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccnd3P30282 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnd3P30282 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms