Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa5P28312 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms