Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gjc1P28229 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms