Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChgaP26339 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChgaP26339 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChgaP26339 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms