Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RarbP22605 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RarbP22605 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RarbP22605 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RarbP22605 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RarbP22605 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RarbP22605 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RarbP22605 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms