Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms