Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms