Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrphP15331 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrphP15331 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrphP15331 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrphP15331 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrphP15331 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrphP15331 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrphP15331 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrphP15331 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrphP15331 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrphP15331 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms