Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms