Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcp1P11983 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcp1P11983 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcp1P11983 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcp1P11983 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcp1P11983 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms