Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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