Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01734 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01734 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01734 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms