Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P01649 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P01649 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01649 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01649 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01649 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01649 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01649 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01649 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01649 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01649 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P01649 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P01649 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01649 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01649 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms