Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifnb1P01575 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifnb1P01575 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms