Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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CcnkO88874 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CcnkO88874 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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CcnkO88874 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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CcnkO88874 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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CcnkO88874 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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CcnkO88874 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CcnkO88874 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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