Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BlmO88700 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BlmO88700 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BlmO88700 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BlmO88700 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BlmO88700 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms