Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbieO54910 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms