Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms