Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FxnO35943 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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FxnO35943 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FxnO35943 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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