Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms