Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clk2O35491 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Clk2O35491 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Clk2O35491 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Clk2O35491 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Clk2O35491 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk2O35491 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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