Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptpn9O35239 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms