Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Eftud2O08810 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms