Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm6871L7N248 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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