Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms